本实验室成立于2002年，于2003年开始与韩国能源所进行生物柴油生产新技术的合作研究，已有2个博士研究生分别在韩国能源所进行了为期一年的合作开发研究。并于2004年开始承担有关生物柴油的国家科技攻关项目、广东省科技攻关和广州市科技计划项目，获得研究经费450万元以上。发表了相关研究论文20余篇，申请生物柴油专利3项。在引进、消化吸收和再创新韩国能源所新技术的基础上，广州能源所现建有以固定床和活塞流反应器为主体设备的年产200吨生物柴油中试生产线，并正与多家企业合作进行生物柴油万吨级工厂建设，生物柴油整体研究和开发水平已达到国际先进水平。

　　实验室自成立以来，经过多年发展，已由早期的生物柴油方向扩展到了各种生物质液体燃料领域的应用及基础研究。主要研究内容包括生物柴油、燃料乙醇、沼气工程、微生物燃料电池、微生物油脂等。目前实验室承担国家自然科学基金项目、国家863项目、国家“十一五”科技支撑项目、中国科学院知识创新工程项目、广东省科技计划项目、国际合作项目、中国科学院人才引进项目、广东省新能源和可再生能源研究开发与应用重点实验室开放基金项目等。与瑞典、意大利、韩国、德国等建立了广泛的合作与交流关系。

　　实验室现有研究人员12名，其中具有高级职称研究人员6名，具有博士学位研究人员7名。正在培养博士研究生5名，硕士研究生8名。